Выборным представительным органом самоуправления факультета является Учёный совет факультета, представляющий коллектив факультета. Состав Учёного совет формируется по представлению факультета и утверждается приказом ректора МГУ.

Факультет возглавляет декан факультета, который является по должности председателем Учёного совета, руководит образовательной, научной, административно-хозяйственной, международной и иной деятельностью факультета, обеспечивает исполнение решений Учёного совета факультета.

Управление структурными подразделениями факультета по различным направлениям осуществляется заместителями декана, назначаемыми приказом ректора МГУ. Распределение обязанностей между заместителями декана устанавливается приказом декана после обсуждения на Учёном совете.